Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC15Q0P6D6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC15Q0P6D6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms