Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TGM3Q08188 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TGM3Q08188 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms