Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HPCAP84074 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HPCAP84074 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HPCAP84074 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms