Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCCD1P59942 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MCCD1P59942 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCCD1P59942 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCCD1P59942 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCCD1P59942 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCCD1P59942 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCCD1P59942 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCCD1P59942 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCCD1P59942 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCCD1P59942 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCCD1P59942 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCCD1P59942 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCCD1P59942 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MCCD1P59942 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MCCD1P59942 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms