Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC10.19□□□□□ -0.78
LINC01547P58512 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms