Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VSX2P58304 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSX2P58304 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSX2P58304 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSX2P58304 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSX2P58304 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VSX2P58304 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms