Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NUP107P57740 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NUP107P57740 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NUP107P57740 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms