Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CASP9P55211 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CASP9P55211 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CASP9P55211 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms