Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC12A2P55011 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms