Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TTPAP49638 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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TTPAP49638 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TTPAP49638 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTPAP49638 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TTPAP49638 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TTPAP49638 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TTPAP49638 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TTPAP49638 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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