Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFP26441 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFP26441 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFP26441 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFP26441 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFP26441 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFP26441 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFP26441 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFP26441 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CNTFP26441 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTFP26441 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTFP26441 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTFP26441 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTFP26441 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTFP26441 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTFP26441 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTFP26441 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CNTFP26441 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CNTFP26441 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CNTFP26441 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFP26441 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFP26441 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFP26441 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CNTFP26441 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms