Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PTMAP06454 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PTMAP06454 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTMAP06454 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTMAP06454 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTMAP06454 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTMAP06454 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTMAP06454 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PTMAP06454 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PTMAP06454 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms