Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
APODP05090 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
APODP05090 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
APODP05090 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms