Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JRKO75564 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JRKO75564 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
JRKO75564 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.4 ms