Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMC8O43402 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMC8O43402 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EMC8O43402 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
EMC8O43402 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EMC8O43402 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EMC8O43402 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EMC8O43402 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EMC8O43402 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMC8O43402 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMC8O43402 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMC8O43402 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMC8O43402 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EMC8O43402 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EMC8O43402 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms