Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CPED1A4D0V7 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms