Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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ARL2-SNX15V9GYD0 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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