Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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