Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
COMMD8Q9NX08 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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