Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IL1RAPQ9NPH3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IL1RAPQ9NPH3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms