Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SLCO1B3Q9NPD5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLCO1B3Q9NPD5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms