Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCAF1Q9H7N4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms