Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SCAPERQ9BY12 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCAPERQ9BY12 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms