Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NICN1Q9BSH3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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