Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLF6Q99612 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms