Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RGMAQ96B86 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms