Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP13Q92995 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP13Q92995 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP13Q92995 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP13Q92995 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP13Q92995 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP13Q92995 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP13Q92995 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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USP13Q92995 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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USP13Q92995 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP13Q92995 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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USP13Q92995 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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USP13Q92995 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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USP13Q92995 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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USP13Q92995 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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USP13Q92995 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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USP13Q92995 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
USP13Q92995 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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