Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MYRIPQ8NFW9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms