Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF548Q8NEK5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF548Q8NEK5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF548Q8NEK5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF548Q8NEK5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF548Q8NEK5 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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ZNF548Q8NEK5 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF548Q8NEK5 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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