Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ZIC4Q8N9L1 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms