Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms