Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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TMCO5AQ8N6Q1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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TMCO5AQ8N6Q1 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TMCO5AQ8N6Q1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TMCO5AQ8N6Q1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TMCO5AQ8N6Q1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TMCO5AQ8N6Q1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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TMCO5AQ8N6Q1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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TMCO5AQ8N6Q1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMCO5AQ8N6Q1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
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