Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KCNMB4Q86W47 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms