Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACAD11Q709F0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms