Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 TCAF2-201ENST00000357344 2958 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
HRCT1Q6UXD1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms