Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CCDC144NLQ6NUI1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CCDC144NLQ6NUI1 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms