Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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PRAMEF20Q5VT98 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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PRAMEF20Q5VT98 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF20Q5VT98 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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