Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
KLHL12Q53G59 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms