Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms