Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SYTL3Q4VX76 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms