Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UPP1Q16831 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms