Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HIF1AQ16665 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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