Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDK4Q16654 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms