Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NTRK2Q16620 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NTRK2Q16620 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NTRK2Q16620 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NTRK2Q16620 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NTRK2Q16620 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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NTRK2Q16620 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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NTRK2Q16620 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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NTRK2Q16620 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NTRK2Q16620 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NTRK2Q16620 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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