Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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FXNQ16595 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FXNQ16595 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXNQ16595 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXNQ16595 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXNQ16595 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXNQ16595 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXNQ16595 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FXNQ16595 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FXNQ16595 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FXNQ16595 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FXNQ16595 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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FXNQ16595 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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FXNQ16595 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FXNQ16595 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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