Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNGA3Q16281 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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