Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
GRIK4Q16099 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GRIK4Q16099 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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