Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
USF2Q15853 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
USF2Q15853 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
USF2Q15853 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
USF2Q15853 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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