Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TRIP13Q15645 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms