Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PKP1Q13835 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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